Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF9O60383 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF9O60383 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF9O60383 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF9O60383 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF9O60383 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF9O60383 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF9O60383 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF9O60383 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF9O60383 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF9O60383 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF9O60383 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF9O60383 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF9O60383 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF9O60383 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF9O60383 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF9O60383 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF9O60383 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF9O60383 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF9O60383 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF9O60383 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF9O60383 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF9O60383 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF9O60383 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF9O60383 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF9O60383 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF9O60383 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF9O60383 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF9O60383 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF9O60383 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF9O60383 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF9O60383 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF9O60383 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF9O60383 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF9O60383 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF9O60383 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF9O60383 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF9O60383 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF9O60383 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF9O60383 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF9O60383 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF9O60383 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF9O60383 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDF9O60383 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDF9O60383 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDF9O60383 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF9O60383 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF9O60383 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF9O60383 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF9O60383 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF9O60383 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF9O60383 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF9O60383 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF9O60383 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF9O60383 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF9O60383 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF9O60383 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF9O60383 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF9O60383 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF9O60383 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF9O60383 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF9O60383 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF9O60383 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF9O60383 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF9O60383 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF9O60383 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF9O60383 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF9O60383 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF9O60383 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF9O60383 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF9O60383 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF9O60383 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF9O60383 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF9O60383 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF9O60383 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF9O60383 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF9O60383 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF9O60383 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF9O60383 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF9O60383 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF9O60383 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF9O60383 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF9O60383 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF9O60383 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF9O60383 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF9O60383 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF9O60383 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.9 ms