Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLXNB1O43157 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PLXNB1O43157 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms