Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B8ZZF3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B8ZZF3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B8ZZF3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B8ZZF3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
B8ZZF3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
B8ZZF3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B8ZZF3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B8ZZF3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B8ZZF3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B8ZZF3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B8ZZF3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B8ZZF3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B8ZZF3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B8ZZF3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B8ZZF3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B8ZZF3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B8ZZF3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B8ZZF3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B8ZZF3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B8ZZF3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B8ZZF3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B8ZZF3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B8ZZF3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B8ZZF3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B8ZZF3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B8ZZF3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B8ZZF3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B8ZZF3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B8ZZF3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
B8ZZF3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B8ZZF3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
B8ZZF3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B8ZZF3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B8ZZF3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B8ZZF3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B8ZZF3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B8ZZF3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
B8ZZF3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B8ZZF3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B8ZZF3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B8ZZF3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B8ZZF3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B8ZZF3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B8ZZF3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B8ZZF3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B8ZZF3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B8ZZF3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B8ZZF3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B8ZZF3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B8ZZF3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B8ZZF3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B8ZZF3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B8ZZF3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B8ZZF3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B8ZZF3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
B8ZZF3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B8ZZF3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B8ZZF3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B8ZZF3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B8ZZF3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B8ZZF3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B8ZZF3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B8ZZF3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B8ZZF3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B8ZZF3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B8ZZF3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B8ZZF3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B8ZZF3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B8ZZF3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B8ZZF3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B8ZZF3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B8ZZF3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B8ZZF3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
B8ZZF3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B8ZZF3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B8ZZF3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B8ZZF3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B8ZZF3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B8ZZF3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
B8ZZF3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B8ZZF3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
B8ZZF3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B8ZZF3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B8ZZF3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B8ZZF3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B8ZZF3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B8ZZF3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms