Protein–RNA interactions for Protein: A6NDG6

PGP, Glycerol-3-phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPA6NDG6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPA6NDG6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPA6NDG6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms