Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LEMD3Q9Y2U8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LEMD3Q9Y2U8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LEMD3Q9Y2U8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms