Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NKIRAS2Q9NYR9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKIRAS2Q9NYR9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS2Q9NYR9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms