Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMOD3Q9NYL9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMOD3Q9NYL9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
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TMOD3Q9NYL9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMOD3Q9NYL9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMOD3Q9NYL9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
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