Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MID1IP1Q9NPA3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MID1IP1Q9NPA3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MID1IP1Q9NPA3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MID1IP1Q9NPA3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID1IP1Q9NPA3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MID1IP1Q9NPA3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms