Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHARPINQ9H0F6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHARPINQ9H0F6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHARPINQ9H0F6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHARPINQ9H0F6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHARPINQ9H0F6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHARPINQ9H0F6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHARPINQ9H0F6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms