Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
UPF3BQ9BZI7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UPF3BQ9BZI7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms