Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS5

AP1M1, AP-1 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1M1Q9BXS5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1M1Q9BXS5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1M1Q9BXS5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1M1Q9BXS5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1M1Q9BXS5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1M1Q9BXS5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1M1Q9BXS5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1M1Q9BXS5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1M1Q9BXS5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1M1Q9BXS5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms