Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP85Q9BW27 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP85Q9BW27 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP85Q9BW27 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms