Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3CQ99613 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3CQ99613 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3CQ99613 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms