Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNN2Q99439 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNN2Q99439 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CNN2Q99439 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNN2Q99439 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNN2Q99439 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CNN2Q99439 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNN2Q99439 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNN2Q99439 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNN2Q99439 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNN2Q99439 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNN2Q99439 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNN2Q99439 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNN2Q99439 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNN2Q99439 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNN2Q99439 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNN2Q99439 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNN2Q99439 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNN2Q99439 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNN2Q99439 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNN2Q99439 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNN2Q99439 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNN2Q99439 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNN2Q99439 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNN2Q99439 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNN2Q99439 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNN2Q99439 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNN2Q99439 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNN2Q99439 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNN2Q99439 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNN2Q99439 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNN2Q99439 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNN2Q99439 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CNN2Q99439 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNN2Q99439 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CNN2Q99439 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNN2Q99439 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNN2Q99439 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNN2Q99439 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNN2Q99439 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNN2Q99439 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNN2Q99439 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNN2Q99439 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNN2Q99439 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNN2Q99439 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNN2Q99439 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNN2Q99439 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNN2Q99439 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNN2Q99439 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNN2Q99439 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNN2Q99439 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNN2Q99439 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNN2Q99439 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNN2Q99439 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNN2Q99439 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms