Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBS4Q96RK4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS4Q96RK4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.6 ms