Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSANTD3Q96H12 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSANTD3Q96H12 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSANTD3Q96H12 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms