Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MKL1Q969V6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKL1Q969V6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MKL1Q969V6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MKL1Q969V6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms