Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC2Q92769 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC2Q92769 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms