Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ73

RFFL, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFFLQ8WZ73 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RFFLQ8WZ73 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFFLQ8WZ73 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFFLQ8WZ73 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms