Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM239Q8WW34 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM239Q8WW34 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM239Q8WW34 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms