Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC4Q8WW27 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms