Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWIST2Q8WVJ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWIST2Q8WVJ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWIST2Q8WVJ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWIST2Q8WVJ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWIST2Q8WVJ9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms