Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPBAR1Q8TDU6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPBAR1Q8TDU6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GPBAR1Q8TDU6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms