Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI38

NFKBID, NF-kappa-B inhibitor delta, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIDQ8NI38 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFKBIDQ8NI38 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIDQ8NI38 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIDQ8NI38 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms