Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMG8Q8ND04 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMG8Q8ND04 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMG8Q8ND04 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms