Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF38AQ8NAV1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38AQ8NAV1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF38AQ8NAV1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF38AQ8NAV1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms