Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP30Q70CQ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP30Q70CQ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP30Q70CQ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms