Protein–RNA interactions for Protein: Q52LC2

ATP6AP1L, V-type proton ATPase subunit S1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1LQ52LC2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6AP1LQ52LC2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6AP1LQ52LC2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6AP1LQ52LC2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6AP1LQ52LC2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6AP1LQ52LC2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6AP1LQ52LC2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms