Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRAMD1BQ3KR37 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD1BQ3KR37 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD1BQ3KR37 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms