Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP5B1Q2VPB7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP5B1Q2VPB7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms