Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ME3Q16798 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ME3Q16798 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ME3Q16798 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ME3Q16798 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ME3Q16798 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ME3Q16798 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ME3Q16798 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ME3Q16798 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ME3Q16798 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ME3Q16798 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ME3Q16798 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ME3Q16798 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME3Q16798 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME3Q16798 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME3Q16798 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME3Q16798 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME3Q16798 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ME3Q16798 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME3Q16798 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME3Q16798 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME3Q16798 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME3Q16798 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ME3Q16798 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ME3Q16798 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ME3Q16798 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ME3Q16798 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ME3Q16798 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ME3Q16798 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ME3Q16798 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ME3Q16798 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ME3Q16798 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ME3Q16798 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ME3Q16798 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ME3Q16798 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ME3Q16798 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ME3Q16798 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ME3Q16798 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ME3Q16798 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ME3Q16798 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ME3Q16798 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ME3Q16798 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ME3Q16798 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ME3Q16798 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ME3Q16798 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ME3Q16798 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ME3Q16798 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ME3Q16798 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ME3Q16798 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ME3Q16798 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ME3Q16798 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ME3Q16798 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ME3Q16798 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ME3Q16798 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ME3Q16798 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ME3Q16798 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ME3Q16798 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ME3Q16798 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ME3Q16798 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ME3Q16798 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ME3Q16798 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ME3Q16798 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ME3Q16798 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ME3Q16798 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ME3Q16798 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ME3Q16798 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ME3Q16798 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ME3Q16798 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ME3Q16798 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ME3Q16798 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ME3Q16798 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ME3Q16798 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ME3Q16798 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ME3Q16798 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ME3Q16798 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ME3Q16798 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ME3Q16798 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ME3Q16798 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ME3Q16798 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ME3Q16798 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ME3Q16798 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ME3Q16798 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ME3Q16798 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ME3Q16798 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ME3Q16798 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ME3Q16798 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ME3Q16798 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ME3Q16798 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ME3Q16798 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ME3Q16798 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ME3Q16798 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ME3Q16798 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ME3Q16798 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ME3Q16798 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ME3Q16798 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME3Q16798 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME3Q16798 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME3Q16798 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME3Q16798 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME3Q16798 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
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