Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE4AQ14139 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
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UBE4AQ14139 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBE4AQ14139 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
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UBE4AQ14139 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
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UBE4AQ14139 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBE4AQ14139 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
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UBE4AQ14139 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
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UBE4AQ14139 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
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UBE4AQ14139 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
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UBE4AQ14139 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE4AQ14139 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE4AQ14139 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE4AQ14139 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBE4AQ14139 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE4AQ14139 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE4AQ14139 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE4AQ14139 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE4AQ14139 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBE4AQ14139 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
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