Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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