Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBBP4Q09028 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms