Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDH1Q08174 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDH1Q08174 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms