Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLEQ07864 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLEQ07864 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLEQ07864 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLEQ07864 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLEQ07864 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLEQ07864 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLEQ07864 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLEQ07864 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLEQ07864 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLEQ07864 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLEQ07864 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLEQ07864 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLEQ07864 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLEQ07864 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLEQ07864 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLEQ07864 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLEQ07864 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLEQ07864 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLEQ07864 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLEQ07864 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLEQ07864 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLEQ07864 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLEQ07864 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLEQ07864 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLEQ07864 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLEQ07864 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLEQ07864 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLEQ07864 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLEQ07864 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLEQ07864 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLEQ07864 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLEQ07864 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLEQ07864 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLEQ07864 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLEQ07864 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLEQ07864 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLEQ07864 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLEQ07864 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLEQ07864 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLEQ07864 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLEQ07864 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLEQ07864 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLEQ07864 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLEQ07864 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLEQ07864 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLEQ07864 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLEQ07864 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLEQ07864 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLEQ07864 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLEQ07864 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLEQ07864 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLEQ07864 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLEQ07864 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLEQ07864 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLEQ07864 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLEQ07864 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLEQ07864 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLEQ07864 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLEQ07864 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLEQ07864 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLEQ07864 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLEQ07864 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLEQ07864 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLEQ07864 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLEQ07864 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLEQ07864 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLEQ07864 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLEQ07864 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLEQ07864 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLEQ07864 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLEQ07864 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLEQ07864 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLEQ07864 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLEQ07864 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLEQ07864 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLEQ07864 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLEQ07864 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLEQ07864 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLEQ07864 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLEQ07864 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLEQ07864 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLEQ07864 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLEQ07864 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLEQ07864 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLEQ07864 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLEQ07864 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLEQ07864 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLEQ07864 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLEQ07864 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLEQ07864 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLEQ07864 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLEQ07864 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLEQ07864 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLEQ07864 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLEQ07864 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLEQ07864 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLEQ07864 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLEQ07864 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLEQ07864 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms