Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM3BP58499 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms