Protein–RNA interactions for Protein: P56557

TMEM50B, Transmembrane protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM50BP56557 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM50BP56557 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM50BP56557 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms