Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA4P52798 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA4P52798 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
EFNA4P52798 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms