Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCIP41743 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCIP41743 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms