Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ITGAEP38570 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
ITGAEP38570 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ITGAEP38570 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms