Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HTR2AP28223 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTR2AP28223 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HTR2AP28223 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms