Protein–RNA interactions for Protein: P21108

PRPS1L1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1L1P21108 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS1L1P21108 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms