Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARBP10826 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARBP10826 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RARBP10826 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARBP10826 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RARBP10826 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARBP10826 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARBP10826 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARBP10826 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RARBP10826 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARBP10826 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARBP10826 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARBP10826 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARBP10826 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARBP10826 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARBP10826 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RARBP10826 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RARBP10826 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARBP10826 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARBP10826 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARBP10826 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RARBP10826 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RARBP10826 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RARBP10826 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RARBP10826 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RARBP10826 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RARBP10826 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RARBP10826 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RARBP10826 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RARBP10826 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RARBP10826 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RARBP10826 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RARBP10826 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RARBP10826 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RARBP10826 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RARBP10826 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RARBP10826 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RARBP10826 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RARBP10826 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RARBP10826 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RARBP10826 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RARBP10826 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RARBP10826 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RARBP10826 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RARBP10826 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RARBP10826 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RARBP10826 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RARBP10826 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RARBP10826 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RARBP10826 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RARBP10826 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RARBP10826 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RARBP10826 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RARBP10826 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RARBP10826 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RARBP10826 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RARBP10826 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RARBP10826 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RARBP10826 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARBP10826 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARBP10826 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARBP10826 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARBP10826 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RARBP10826 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARBP10826 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARBP10826 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARBP10826 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARBP10826 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARBP10826 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RARBP10826 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARBP10826 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARBP10826 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARBP10826 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARBP10826 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARBP10826 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARBP10826 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARBP10826 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARBP10826 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARBP10826 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RARBP10826 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARBP10826 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARBP10826 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RARBP10826 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARBP10826 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARBP10826 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARBP10826 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARBP10826 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RARBP10826 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARBP10826 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARBP10826 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARBP10826 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARBP10826 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARBP10826 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARBP10826 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RARBP10826 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RARBP10826 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RARBP10826 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RARBP10826 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RARBP10826 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARBP10826 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms