Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS17P08708 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS17P08708 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS17P08708 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS17P08708 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS17P08708 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS17P08708 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS17P08708 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS17P08708 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS17P08708 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS17P08708 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS17P08708 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS17P08708 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS17P08708 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS17P08708 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS17P08708 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS17P08708 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS17P08708 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS17P08708 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS17P08708 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS17P08708 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS17P08708 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS17P08708 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS17P08708 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS17P08708 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS17P08708 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS17P08708 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS17P08708 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS17P08708 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS17P08708 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS17P08708 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS17P08708 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS17P08708 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS17P08708 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS17P08708 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS17P08708 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS17P08708 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS17P08708 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS17P08708 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS17P08708 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS17P08708 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS17P08708 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS17P08708 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS17P08708 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS17P08708 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS17P08708 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS17P08708 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS17P08708 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS17P08708 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS17P08708 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS17P08708 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS17P08708 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS17P08708 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS17P08708 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS17P08708 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS17P08708 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS17P08708 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS17P08708 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS17P08708 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS17P08708 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS17P08708 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS17P08708 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS17P08708 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS17P08708 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS17P08708 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS17P08708 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS17P08708 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS17P08708 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS17P08708 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS17P08708 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS17P08708 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS17P08708 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS17P08708 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS17P08708 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS17P08708 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS17P08708 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS17P08708 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS17P08708 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS17P08708 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS17P08708 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS17P08708 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS17P08708 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS17P08708 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms