Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX3O95343 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX3O95343 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX3O95343 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX3O95343 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX3O95343 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX3O95343 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX3O95343 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX3O95343 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX3O95343 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX3O95343 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX3O95343 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX3O95343 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIX3O95343 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIX3O95343 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX3O95343 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX3O95343 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX3O95343 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX3O95343 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX3O95343 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX3O95343 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX3O95343 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX3O95343 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX3O95343 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX3O95343 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX3O95343 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX3O95343 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX3O95343 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX3O95343 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX3O95343 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX3O95343 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX3O95343 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX3O95343 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX3O95343 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX3O95343 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX3O95343 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX3O95343 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX3O95343 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX3O95343 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX3O95343 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX3O95343 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX3O95343 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX3O95343 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX3O95343 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX3O95343 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX3O95343 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX3O95343 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX3O95343 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX3O95343 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX3O95343 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX3O95343 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX3O95343 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX3O95343 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX3O95343 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX3O95343 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX3O95343 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX3O95343 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX3O95343 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIX3O95343 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIX3O95343 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIX3O95343 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIX3O95343 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIX3O95343 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX3O95343 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX3O95343 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX3O95343 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX3O95343 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX3O95343 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX3O95343 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX3O95343 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX3O95343 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIX3O95343 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX3O95343 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX3O95343 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX3O95343 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX3O95343 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX3O95343 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX3O95343 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIX3O95343 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX3O95343 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX3O95343 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX3O95343 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX3O95343 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIX3O95343 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms