Protein–RNA interactions for Protein: O75871

CEACAM4, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM4O75871 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM4O75871 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM4O75871 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms