Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCM3APO60318 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM3APO60318 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM3APO60318 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms