Protein–RNA interactions for Protein: O15260

SURF4, Surfeit locus protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF4O15260 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SURF4O15260 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SURF4O15260 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SURF4O15260 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SURF4O15260 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SURF4O15260 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SURF4O15260 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SURF4O15260 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SURF4O15260 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SURF4O15260 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SURF4O15260 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SURF4O15260 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SURF4O15260 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SURF4O15260 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SURF4O15260 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SURF4O15260 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SURF4O15260 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SURF4O15260 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SURF4O15260 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SURF4O15260 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SURF4O15260 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SURF4O15260 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SURF4O15260 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SURF4O15260 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SURF4O15260 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SURF4O15260 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SURF4O15260 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SURF4O15260 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SURF4O15260 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SURF4O15260 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SURF4O15260 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SURF4O15260 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SURF4O15260 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SURF4O15260 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SURF4O15260 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SURF4O15260 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SURF4O15260 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SURF4O15260 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SURF4O15260 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SURF4O15260 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SURF4O15260 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SURF4O15260 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SURF4O15260 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SURF4O15260 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SURF4O15260 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SURF4O15260 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SURF4O15260 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SURF4O15260 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SURF4O15260 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SURF4O15260 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SURF4O15260 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SURF4O15260 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SURF4O15260 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SURF4O15260 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SURF4O15260 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SURF4O15260 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SURF4O15260 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SURF4O15260 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SURF4O15260 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SURF4O15260 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SURF4O15260 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SURF4O15260 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SURF4O15260 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SURF4O15260 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SURF4O15260 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SURF4O15260 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SURF4O15260 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SURF4O15260 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SURF4O15260 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SURF4O15260 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SURF4O15260 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SURF4O15260 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SURF4O15260 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SURF4O15260 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SURF4O15260 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SURF4O15260 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SURF4O15260 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SURF4O15260 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SURF4O15260 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SURF4O15260 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SURF4O15260 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SURF4O15260 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SURF4O15260 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SURF4O15260 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SURF4O15260 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SURF4O15260 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SURF4O15260 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SURF4O15260 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SURF4O15260 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SURF4O15260 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SURF4O15260 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SURF4O15260 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SURF4O15260 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SURF4O15260 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SURF4O15260 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SURF4O15260 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SURF4O15260 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SURF4O15260 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SURF4O15260 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SURF4O15260 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms