Protein–RNA interactions for Protein: B1ANY3

FAM220BP, Putative protein FAM220BP, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BPB1ANY3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM220BPB1ANY3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms